Nature Communications|嘉因生物CUT&Tag客户文章|CUT&Tag研究胰腺导管癌潜在靶点

2024-03-28 15:18

胰腺导管癌（PDAC）是全球第四大癌症现相关死亡因素，分子分型已被用于指导许多癌症的临床治疗，如乳腺癌和结肠癌，但尚未在PDAC中发挥作用。2023年10月，中山大学肿瘤中心林东昕院士团队和美国芝加哥大学何川教授团队合作在Nature Communications上发表学术论文“CSTF2 mediated mRNA N6-methyladenosine modification drives pancreatic ductal adenocarcinoma m6A subtypes”，文章发现RNA上的m6A修饰可以区分两种预后结果不同的PDAC亚型，这两种亚型的发生受到新发现的m6A调节蛋白CSTF2驱动。文章还发现大多数CSTF2调控的m6A对宿主基因的RNA水平有正向影响，这些m6A修饰主要被m6A Reader蛋白IGF2BP2识别。文章结果为PDAC的分型策略和精准医学治疗提供了潜在的靶点。

文中CUT&Tag实验由嘉因生物协助完成。

上海嘉因生物

中国表观遗传学技术服务领跑者

嘉因生物-CUT&Tag介绍

CUT&Tag可以在全基因组范围内定位转录因子的结合位点或者组蛋白修饰发生的位置。CUT&Tag使用ProteinA-Tn5融合蛋白来结合目的蛋白上的抗体，并特异性切割目的蛋白结合的DNA，最终实现靶蛋白结合位点的精准定位。相比于ChIP-seq而言， CUT&Tag 的数据信噪比高、所需细胞数少，测序量小并且实验重复性高。

scCUT&Tag，即单细胞CUT&Tag，可以进一步了解，指定的转录因子或者组蛋白修饰，在细胞群体中每一个细胞中的结合位置。

嘉因生物-CUT&Tag优势

优势一 2021年7月，国内第1篇由服务商提供CUT&Tag服务的文章发表于Genome Biology。截止至2023年8月，嘉因已累计协助客户发表CUT&Tag文章78篇，总影响因子超过600分，包括Nature Genetics, Signal Transduction and Targeted Therapy, Cell Discovery 等顶尖杂志。

优势二嘉因生物8年来，积累了超过300种的成功实验抗体库，向老师们推荐高成功率的转录因子抗体和组蛋白修饰抗体。CUT&Tag项目进行高标准交付（人的经典DNA结合蛋白，MACS2 Q-value= 0.05下至少500个peak）。

优势三延续嘉因生物5年来的ATAC-seq的丰富提核经验，针对各种组织器官类型的CUT&Tag项目的提核更得心应手。嘉因已完成1500+例CUT&Tag实验，涉及到的物种和组织器官组合200+。

优势四生信分析售后团队可以完成各类CUT&Tag定制化分析。