R-loop CUT&Tag系列文章之三：R-loop与转录终止

       接着R-loop概览和R-loop与表观调控，本篇文章将阐述R-loop与转录终止的关系，即R-loop可能导致Pol II（RNA polymerase II）暂停和转录终止的机制。

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R-loop可能阻止Pol II回溯

       R-loop可能能够阻止Pol II回溯。Pol II在转录延伸与回溯之间来回摆动，而R-loop的存在可能能够终止Pol II的回溯功能。

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R-loop与扭转应力导致Pol II停滞

       在转录过程中，R-loop的位置相对于DNA的螺旋结构保持固定，而Pol II的延伸则持续沿着螺旋路径旋转。因此，R-loop下游产生的新生转录物必须包裹在DNA周围，可能会因扭转应力的积累而导致 Pol II停滞。

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R-loop与终止效应器

       R-loop可以促进双链RNA的产生，从而招募RNase Dicer和组蛋白甲基转移酶G9a，形成抑制性染色质环境，促进Pol II暂停。相反，若R-loop识别或溶解酶存在缺陷，如RNA解旋酶senataxin(SETX)、DExH-box解旋酶9(DHX9)、DEAD-box解旋酶5(DDX5) 和 5'-3'核糖核酸外切酶2(XRN2)等缺陷，则会诱导全基因组R-loop累积，损害某些基因的转录终止（由Pol II甚至是Pol III转录的基因）。