The EMBO Journal | 上海嘉因生物植物ChIP-seq客户文章 | PIF7介导拟南芥避荫反应中表观遗传重编辑的调控机制

     对于不耐荫的植物，与周围竞争引起的光质变化会引发避荫反应综合症 (shade avoidance syndrome, SAS)即一系列最终对植物健康和作物产量有害的形态和生理适应。在拟南芥中，光敏色素互作因子7（PIF7）是SAS的主要转录调节因子，但其如何调控基因表达尚不完全清楚。本研究表明PIF7直接与组蛋白伴侣抗沉默因子1(ASF1) 相互作用。ASF1缺失的asf1ab突变体表现出有缺陷遮荫诱导的下胚轴伸长。组蛋白调节同源物A(HIRA)参与SAS，并介导H3.3变体在染色质中沉积。RNA/ChIP-seq分析确定了ASF1直接调节部分PIF7靶基因。此外，通过PIF7-ASF1-HIRA调节模块介导遮荫引发基因激活，伴随H3.3的富集。

    文中ChIP-seq实验由上海嘉因生物协助完成。